מאַרינאַ לאַזאַרעוואַ, אַ 10טע קלאַס סטודענטקע אין דעם ספּעציאַליזירטן בילדונגס־וויסנשאַפטלעכן צענטער פון נאָוואָסיבירסק שטאַט־אוניווערסיטעט (SESC NSU), צוזאַמען מיט אירע וויסנשאַפטלעכע סופּערווייזערס, האָט אַנטוויקלט אַ טעסט־סיסטעם וואָס דערמעגלעכט שנעלע דעטעקציע פון שוואָמען פון דעם מין. Verticillium אָן די נויט פֿאַר טייערע עקוויפּמענט. די פּאַטאָגענס אַפעקטירן איבער 200 פלאַנצן מינים, אַרייַנגערעכנט קאַרטאָפל, און פאַראורזאַכן באַדייטנדיק יערלעך שאָדן צו לאַנדווירטשאַפט. טראַדיציאָנעלע דיאַגנאָסטישע מעטאָדן נעמען 7 ביז 14 טעג, מאַכנדיג גרויס-מאָסשטאַב סקרינינג שווער. כאָטש PCR אַנאַליז איז שנעלער, דאַרף עס קאָמפּלעקסע און טייערע מאַשינערי. דער יונגער פאָרשער פֿון נאָוואָסיבירסק האָט פֿאָרגעשטעלט אַן אָלטערנאַטיוו — LAMP טעכנאָלאָגיע (לופּ-מעדיאַטעד איזאָטערמאַל אַמפּליפיקאַציע), אַ העכסט סענסיטיווע DNA קאָפּירונג מעטאָדע וואָס אַרבעט ביי אַ קאָנסטאַנט טעמפּעראַטור. עס דאַרף נישט קיין טערמאַל ציקלער און קען דעטעקטירן דעם פּאַטאָגען אין 30-60 מינוט אין אַ נאָרמאַל לאַבאָראַטאָריע אָדער אפילו אין פֿעלד באַדינגונגען.
ערשטנס, האט דער סטודענט דורכגעפירט א ביאאינפארמאטישע אנאליז פון דנ״א סיקווענצן פון צען פארשידענע Verticillium מינים און אידענטיפיצירט א געמיינזאמען סעגמענט. זי האט דערנאך גענוצט ספעציאליזירטע ווייכווארג צו דיזיינען פריימערס - קורצע מאלעקולן וואס דערקענען און בינדן זיך נאר צו דער ציל פאטאגען'ס דנ"א. די הויפט שוועריקייט איז געווען נישט-ספעציפישע רעאקציעס, וואו דער טעסט האט זיך אויסגעלאזט אפילו אין ריינע מוסטערן אן דעם פונגוס. דורך אפטימיזירן באדינגונגען - צופאסן טעמפעראטור, פארגרעסערן פריימער און מאגנעזיום יאן קאנצענטראציעס, און ניצן א "הייס סטארט" טעכניק - איז הויכע ספעציפיטי דערגרייכט געווארן. די טעסט סיסטעם רעאגירט יעצט נאר צו דער ציל פונגוס'ס דנ"א און האט ערפאלגרייך דורכגעגאנגען עקספערימענטאלע וואַלידאציע.





